科技，现代化，机械，钢铁……
一切的一切逐步将原来美丽而多彩的世界变得冰冷而无趣，人类的欲望没有止境，战争，掠夺，杀害，将这个世界染上悲惨的色彩，火焰在森林烧，导弹爆炸掀起海浪，黑烟尘埃布满了天空。
终于……人类的母亲地球，愤怒了，从海底出现的神秘舰队群，摧毁了人类的一切。
深海栖舰，这是人类对她们的称呼，从驱逐舰级到超弩级大型战舰，在深海栖舰多种多样的攻击下从制海权开始，人类逐渐丧失了一切。
人类的舰队被击毁，卫星被不知名的力量放逐向宇宙，最终，人类只能躲在大陆深处，苟延残喘。
然而，母亲终究是仁慈的，会对做错事的孩子惩罚，却也一定不会让孩子过于受伤，地球母亲也是一样，在诞生出深海栖舰这样能够毁灭人类的怪物同时，也给了人类能够与之对抗的唯一存在。
那就是拥有昔日战舰之魂的少女，舰娘！
诞生于各种战舰之上，与人类一样的外表，然而却拥有人类所没有的强大身体，拥有人类所没有的力量，于此同时……也拥有对人类这一种族的挚爱与忠诚。
这份感情，或许就是她们诞生于那些战舰的最根本证据吧。
因为战舰就是诞生在人类的手中，虽然被用作战争，用作杀戮，但依旧不能否认，人类是战舰的建造者，是舰娘最初的父亲这一事实。
从舰娘诞生开始，每一个舰娘都会将从深海栖舰的枪炮下守护人类当成自己唯一的使命，能够为之献出一切的使命。
人类接受了舰娘，并在大陆建立了总督府，在各个海港设立了镇守府，以此对抗深海栖舰。
舰娘相信并忠诚着人类，用自己的力量，守护着人类，用枪炮，用自己的血肉，与深海栖舰战斗在海平面之上。
一切都向美好的方向发展着，随着越来越多舰娘的诞生，越来越多优秀提督的出现，人类逐步逐步，犹如蚕食一样的从深海栖舰手中夺回了制海权。
然而……就在一切都那么美好的那一天。
大概地球母亲都没有想到吧，竟然会有一个强盗强行进入了家门。
小到没有任何人发现的东西，从天而落，掉入了还处于深海栖舰的管制范围内的海域。
一艘深海栖舰异变了，变得无比的巨大，也变得无比强大，仅仅只是一炮，就击沉了为数上千的舰娘，也仅仅只是一炮，就将海港连同镇守府从地图抹去。
越来越多的深海栖舰异变了，虽然不及最初那艘那样强大，但也比之前厉害许多，尽管人类拥有许多优秀的提督，尽管有着许多强大舰娘，但终究在异变深海栖舰的枪炮下节节败退，一个一个海港镇守府被毁去，一个一个舰娘被击沉。
终于，连人类苟延残喘的大陆之地，都被深海栖舰长年累月一炮一炮的轰碎了。
抱着必死的决心，抱着同归于尽的意志，人类与舰娘动用了最后的武器。
被保存在人类各个国家秘密基地的核弹全部被取了出来，总共三千余枚核弹，由最强大的舰娘携带装载，每一个舰娘装载一枚，向着那些异变的深海栖舰发起了冲锋。
连地球母亲这一刻都站到了人类的身边，鱼群，海啸，帮助着舰娘，终于在三千余枚核弹，三千多个强大舰娘的牺牲之下，绝大部分的变异深海栖舰，包括最初那艘都被击沉了。
可是，三千余枚的核弹，所产生的辐射等副作用，也将人类这个种族彻底的从地球抹去了，仅仅只有零星几个幸存者残留下来，与他们同样幸存下来还有为数不多的舰娘。
幸存下来的人类以及舰娘，断绝了一切的希望，所拥有的意志，也只剩下向那些残存的深海栖舰复仇了。
……
海面是墨黑色的，悬浮着各种死鱼，腐臭味充斥了空气，与之夹杂的还有浓浓的弹药硝烟的味道。
噗噗、噗噗、平静的海面忽然冒起了气泡。
一个身披黑红色彩狰狞铠甲，皮肤惨白双目无神的少女从海底出现了，她的目光眺望向远方，海平面之间那一座像黑点一样的小岛。
缓缓的抬起手臂，她的手指指向那里。
噗噗噗噗噗……
更多的气泡从海里面出现，黑红铠甲少女的身边浮现出，一艘艘狰狞异常的战舰，战舰只是功能上面的相同，然而外形却是根本看不出是战舰，比怪物更加怪物，可怕骇人。
她，它们，也就是深海栖舰！