自东海龙族一脉归附人族之后，人族势力大增，诸多族群都开始了扩张之路。而其中最为强大的当属九黎部落以及有熊氏部落。两个部落肆意扩张，吞并了不少的小部落，若不是还有神农在上面压着，恐怕早都已经掀起了人族大战。饶是如此，也让神农苦恼不已，尤其是如今他渐感功德圆满，需要寻找下一任的继任之人。却在此时乱象渐生，神农也是不知如何是好，只好去寻求自家老师孔宣相助。
却说神农来到孔宣修行之地，只看到一间极为朴素的茅屋，孔宣正一袭青衫坐在茅屋前看，身上丝毫没有一点神通大能的气势，在神农看来反而更像人族之中那些年老的智者一般。许是孔宣看入神了，竟是没有察觉道神农的到来，直到神农近前问礼之后，孔宣方才回过神来，放下手中卷问道：“神农啊，今日怎么有时间来为师这里了？”神农将自身之困惑说与孔宣。
孔宣闻言略微思量后答道：”此事为师却是帮不得你，此乃是人族之事，需得自身解决，外人难以插手。你莫要心急，此时时机尚未圆满，你且安心等待，自有其解决之日。“闻言，神农虽是不解，却也只好无可奈何的离去了。
而就在这个时候，尚在蓬莱岛静修的青羽却是接到了平心的传讯让其往幽冥一行。青羽却是知道平心何意，只不过早有约定，也是不再迟疑，径直破开空间来到了幽冥地府中的平心宫内。
只见平心与青羽相对而坐，随后平心道：“早前与道友已有约定，此番却是道友践诺之时了。”青羽问道：“不知娘娘有何吩咐，贫道自当效劳。”只见平心拿出一道真灵递给青羽，而后说道：“此事却是不难，只需道友将此真灵投入人道轮回之中即可，其余自有本宫行事。”青羽接过这道真灵，沉吟片刻问道：“娘娘当真如此，可知天命难违啊。”却见平心笑道：“我当年身化轮回便是想给我巫族留一后路，但结果呢？我等兄弟姐妹十二人死伤殆尽，唯有玄冥妹妹在这阴山之地苟延残喘，其余族人更是寥寥无几。我等也是盘古父神血脉，何至于此？即是天道不眷顾于我等，便只好奋力拼上一把，也无愧于我等血脉了。”青羽叹了口气道：“也罢，即是贫道有言在先，自当奉命而行，只是苦了这芸芸众生，又有一场浩劫降临啊。”随后就去往人道轮回之地，将这真灵交予善尸。平心宫中，青羽离去之后，却是又转出一道身影，正是十二祖巫中唯一幸存的玄冥祖巫。只见其走到平心身边道：“姐姐，可是都安排好了？”平心点点头道：“依计行事吧。只希望父神保佑我等，大事可成啊。”随后两人身影消失，只剩一声叹息回荡在宫殿之中。
而就在青羽与平心议事之时，有熊氏部落却是有一新生儿诞生了，正是有熊氏族长少典的儿子，却说这小孩出生之时天降异象，随后便有玉清圣人之徒广成子驾临将其收为弟子并赐名轩辕，这可让有熊氏上下都兴奋不已。这种上仙收徒的经历在人族可是早有先例，前两位人族共主都是一出生就被人收为门徒，之后便是为人族发展做出了巨大的贡献，最后被尊为人族共主的。如今看来，这轩辕也是有望问鼎人族共主之位，怎能不令人激动呢。
就在轩辕降生之时，九黎部落中也是有一孩童降世，随后便有两位自称九凤与相柳的人来到部落之中成为了九黎部落的长老，将这新生的孩童收为弟子并命名为蚩尤。话说这九黎部落乃是身怀巫族血脉之人，上古之时，人族刚刚出生，却是托庇于巫族之下，时常有巫族与人族之人结合，诞下的孩子都是身怀人巫两族血脉之人。后来，巫族败落，隐匿于洪荒之上，但这些身怀巫族血脉的人族却是流传了下来并汇聚成族，自称九黎。由于身怀巫族血脉，九黎族人皆是力大无穷且生性好战，全族上下无论男女，皆可成兵。
随后，在广成子与相柳九凤的教导之下，轩辕与蚩尤也是渐渐长大且各自都表现出异于常人的地方。待到两人都成年之后，都成为了各自部落的主事之人，在两人的带领之下，九黎与有熊氏也是更加的强大，便是比之神农出身的姜氏部落也是不弱分毫。而这轩辕与蚩尤也是进入了神农的视线之中，神农有意在这两人中选出下一任的人族之主。
随后，神农便将两人的经历事无巨细的收集了起来，详加了解。最后却是有意将共主之位传于轩辕。两人比之能力不差分毫，甚至蚩尤尤胜于轩辕几分。但蚩尤天性暴虐，嗜战成性，动辄便是将敌对部落全族夷灭。相比之下，轩辕虽说也是精于战事，但心性仁慈，对败落之部族也是多以怀柔之术收复，更合于神农之观念。
即是打定了主意，神农也就不再耽搁。将轩辕召至陈都加以教导。随后就传令人族，将共主之位传于有熊氏轩辕。但令神农意想不到的事，对于这个决定，却有一部分部落并不认同。其实这也正常，想当初伏羲与神农成为人族共主的时候都是为人族的发展做出了巨大的贡献，得到所有人族的认可与尊崇，成为人族共主可谓是顺理成章。但轩辕虽然在人族之中也是颇有声望，但比之伏羲与神农还是差距不小，况且还有一个可以与之比肩的蚩尤，自难然是难以让所有的人族部落信服。但毕竟神农现如今还是人族共主，既然一声令下，虽是心有不服，却还是赶到了泰山参加了禅让大典。
在青羽等三人的见证下，神农将崆峒印等信物交予轩辕，成为了新一任的人族共主。随后，天降功德，只见神农气势节节攀升，最后同伏羲一般臻至至人之境，随后神农得真灵也是觉醒前世记忆，正是当初被帝俊等人围攻，最后自爆身死得红云老祖。而跟随青羽一同前来得镇元大仙也是显出身形来到神农身边，只见镇元子道：“红云道友，好久不见了。”只见神农哈哈大笑道：“红云不在，如今我为人皇神农。不过却是要多谢道友此番谋划，却是令老道得以重生啊。”镇元子道：“此事老道却是不敢居功，还是全靠青羽道友操劳。”闻言，青羽推辞道：“道友言重了，神农道友福德深厚，合该有此机缘，贫道却是不敢邀功。”闻言三人皆是大笑，青羽也是取出九九散魂葫芦交还神农，神农收起法宝随后道：“如今我为人皇，却是不好在此间多加逗留，还是要早去红云洞坐镇。我等日后再见。”说完就转身离去，端的是洒脱无比。而孔宣也是得教导人皇之功德之助，顺利斩尸。不过他却是不同常人，首先斩去得竟是恶尸，倒是别有一番奇妙。
而就在轩辕接任人族共主之时，九黎部落在蚩尤的带领下公开反对轩辕，并同时出兵向着陈都所在攻来。
轩辕成为人族共主本就有人心中不服，加之九黎兵锋强盛，等闲部落根本就难以抵挡，蚩尤大军竟是一路势如破竹的来到了陈都附近的涿鹿之地驻扎了下来。而此时轩辕也是赶回了陈都召集大军来到涿鹿与蚩尤遥相对立。随后，蚩尤主动邀战轩辕，谁曾想轩辕却是九战九败。一时间军心士气大跌，连带着原本臣服于轩辕得人族部落此刻也是流言四起，顷刻之间，轩辕这人族共主之位竟是有颠覆得危险。
其实这也怪不得轩辕无能。着实是九黎一族的族人堪称天生得战士，无论体魄还是搏斗之术都是远远胜于寻常人族，即便轩辕所率领的大军也都是各个部落的精锐战士组建而成，但比之九黎大军仍是相去甚远，轩辕能勉强不令得大军溃散已是费尽心思，和谈反攻乃至战胜蚩尤。
而此刻天庭之中，昊天与瑶池坐在凌霄殿中却是借助昊天镜观察着蚩尤与轩辕的大战。昊天略有思量的说道：“要不要帮上轩辕一把？”瑶池闻言问道：“陛下如何会有这等想法？”昊天笑道：“人族为天地主角乃是天道注定，而这轩辕乃是玉清圣人扶持，虽说眼下不敌蚩尤，但日后必定能坐稳这人族共主的位置，我天庭想要壮大必定少不了人族相助，毕竟这人族之中修行成仙之辈不在少数，与之交好眼下正是合适。”瑶池道：“陛下既然已经决定，本宫自是同意。不知陛下可有人选？”昊天道：“王母座下的玄女擅长战阵兵争之法，正是合适人选。”瑶池闻言也未反对，当即命人召来玄女，随后昊天又耳提面命了一番，玄女便下凡而去。
同时，青羽也是召来灵月，将之前重新炼制的屠巫剑交予她，让其前去赐给轩辕，灵月当即领命而去。
却说涿鹿轩辕大军的主帅大帐中，轩辕正愁眉苦脸的坐在主位之上苦思破敌之法。正当此时，却是听到帐外传来一阵喧闹之声，轩辕本就心烦，便走出帐外准备呵斥吵闹之人，却看到一美貌女子从天而降，轩辕跟随广成子修行，自是有所见识。当即上前见礼道：“人族共主轩辕见过仙子。”这女子正是奉昊天之命前来相助轩辕的玄女，只见其上前扶起轩辕道：“当不得共主如此大礼，我乃王母座下九天玄女，奉玉帝之命特来辅助共主，助共主破去敌军。”轩辕闻言大喜道：“仙子有何教我？”只见玄女取出三卷玉简递给轩辕道：“此中记载了，演练兵马行军布阵之法，当可助共主一臂之力。”轩辕连忙接了过来。就在轩辕准备邀请玄女进帐一叙之时，却是又有一人从天边飞来。轩辕看去却发现只是一个女童。轩辕走上前去问道：“不知小仙童从何而来？”那女童正是灵月，只听得灵月说道：“我乃是青羽道君座下童子，特奉老爷之命，前来将此剑赠与共主。”说罢取出青羽所炼之剑递给轩辕。轩辕也是有见识之人，自是认得此剑非是凡品，当即跪倒在地遥向东方行礼叩首道：“拜谢圣父恩赐。”随后又起身问向灵月：“不知此剑可有名字？”灵月闻言却是愣了一下道：“这个老爷没说，不过既然是给你的，你就自己起个名字吧。”说完也不待轩辕反应就飞身而去，见状轩辕只好苦笑一番，就引着玄女进帐，去请教玉简之中所记载的内容。
这等仙家战阵兵争之法着实不凡，在玄女的教导之下，轩辕依法操练兵马，演练阵势，随后主动邀战，竟是将九黎大军杀的大败而归，顿时轩辕麾下兵马士气大涨。
而九黎大军之中，蚩尤高坐帅位之上，其下是各路将领。而在两旁首位之上却是坐着两个并非军中装束的男女，正是九黎部落的两位长老，九凤与相柳，也是蚩尤的老师。只听得蚩尤问道：“两位老师，这轩辕不知得了何人相助，竟是在短短几日间实力大增，将我军杀的大败。不知两位老师可有破解之法？”九凤微微一笑道：“此事不难，你也知九黎一族乃是传自巫族血统，上古之时，巫族有一绝世阵法名为十二都天神煞大阵。此阵一出，便是连至高无上的圣人也可争锋一二，我等后辈无能难以重现祖巫风采，只从这大阵中重新参悟出一道阵法名为玄阴戮煞大阵。此阵需以玄冥煞气炼制八十一杆阵旗，而后你麾下将士以此分为八十一路，各持一道阵旗布下大阵，当可一举歼灭轩辕大军，问鼎共主之位。”蚩尤闻言大喜，连忙道：“即有此神阵，还请老师教我。”九凤拜拜手道：“此事不急，这阵法需有一主阵之人，你如今修为尚浅，还需提升修为，这阵旗自有我和相柳解决。这时玄冥祖巫赐下的祖巫精血，你将此炼化且先提升修为，方能完全发挥大阵威力。”说着取出一个玉瓶递给蚩尤，蚩尤接过玉瓶道：“即是如此，就幸苦两位老师了。待我出关之日必一举荡平轩辕大军，让我九黎一族执掌人族，重现上古巫族之雄风。”
之后，蚩尤闭关，九凤与相柳主持炼制玄阴戮煞大阵阵旗，九黎大军也在各自将领的带领下演练阵势。这连日来厮杀不停的涿鹿之地竟是迎来了短暂的平静。而轩辕也乘此机会抓紧时间操练兵马，玄女所赠兵博大精深，轩辕也未完全掌握，正好乘此机会修习。
两方各自积蓄实力，等待着下一次大战的开始。