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在战场上，土耳其逐渐被欧洲大陆的军事技术赶过，宗教及知识份子保守派的壮大扼杀了土耳其的军事革新。欧洲军事革命对战略及军备的改变使以往令人闻风丧胆的西帕希骑兵的威胁减弱。在对抗哈布斯堡王朝的冗长战争里，帝国需要大量配备火器的步兵，于是放宽募兵政策，使土耳其新军的数量大为提高，但却引起了军纪、兵士素质等问题，政府甚至需要应付军士哗变。
欧洲提倡火枪而发展的长矛与火枪及线性战术对土耳其军造成致命打击。土耳其军招募了一些非正规的狙击手应付战争，在复员后一些狙击手在杰拉里叛乱里沦为土匪，杰拉里叛乱让安那托利亚在16世纪末及1世纪初陷入无政府状态。至1600年，奥斯曼帝国的人口达到三千万，对土地短缺的诉求亦对政府构成压力。
苏丹女权时期(168-1656年)是土耳其后宫对政治有很大影响力的一个时期，由太后代表儿子行使权力，这并非前所未有。?许蕾姆苏丹在1530年代初继承鲁班纽苏丹成为苏丹皇太后，她被威尼斯拜罗安德里亚·杰里迪形容为"极度善良、有胆识及聪慧的女人"。由于伊卜拉欣一世无力管治国家以及166年年幼的穆罕默德四世登位，政务就交帝国后宫治理，这时期最着名的女性是柯塞姆苏丹及其儿媳杜亨·哈提婕，其中柯塞姆苏丹因摄政招致政敌在1651年将她杀害。